通常把发现假说比喻为收集碎片以拼出整幅图画，或者喻为发现线索以侦破案件，或者是我们喜欢的比喻：对疾病的诊断。在听说你的腿发麻后，医生会问你一系列问题：腿麻的确切位置？何时开始有腿麻症状的？是突然有此症状的吗？是否有麻得更厉害的时段？另一条腿也麻吗？腿麻的情况和你的活动或姿势有关吗？你曾受过伤吗？你抽烟吗？你患有高血压吗？你还有其他症状吗？医生还会考虑你的年龄、生活方式、病史及你的家族病史。医生的调查检测了一系列症状（或没有这些症状），其中一些是神经科的、一些是骨科的可能还有精神科的等等。医生试图从中查明最紧密的联系并由此诊断病人的情况。诊断就是医生的因果假说。它代表着医生对各种症状和其他信息的最佳解释。
我们把这种形成因果假说的方法叫做最佳诊断方法 （best diagnosis method），以区分于求异法和求同法。发生了一起谋杀案，侦查人员已经锁定了3个嫌疑人。亚当的枪是作案工具。在回答案发时他在哪里时，亚当撒谎了。亚当和死者是好朋友，侦查人员没有发现亚当有作案动机。布兰迪欠了死者的钱，他公开威胁过死者，他还接触过亚当的枪，但他有自己的辩护。科克斯在案发时出现在现场附近，他认识死者，也可能接触过亚当的枪，但他没有明显的动机。像医疗案例一样，侦查人员试图发现对一系列“症状”的最佳“诊断”，诊断决定于“症状”和“疾病”之间的联系，这里的“疾病”就是谋杀，“症状”就是与下列相关的：作案工具、认识死者、出现在案发现场、有作案动机、对自己案发时在哪里的问题说谎等等。亚当表现出一些“症状”，布兰迪和科克斯表现出另一些。如果布兰迪的辩护被揭穿，侦查人员就会将他列为头号嫌疑人。
什么是最佳诊断？除得到验证的以外（见11.4节），这个问题没有抽象的答案。但可以说明的是，最佳诊断不必是解释了大多数“症状”的。各种症状的重要性并不相同。对于谋杀案形成“诊断”（假说），作案工具上的指纹是不可忽视的，对警察撒谎也是不可忽视的。在尼科尔·布朗·辛普森和罗纳德·戈德曼被杀的案件中，轿车司机举证说案发时在辛普森门口的对讲机前联系不上他固然重要，但（我们认为）对于侦查人员而言，更重要的是在布朗的公寓外发现了沾有辛普森和两名死者血迹的手套。
你会发现，在运用这种方法形成因果假说时，指引方向的是背景知识。在诊断疾病原因时，医生比其他人做得更好。在侦破刑事案件时，警察比其他人更能胜任。在解释历史事件时，史学家比其他人完成得更出色。我们自己所提出的因果假说中，最好的也出现在最熟悉的领域。
语言不当的名字首字母会减短寿命
加州大学圣迭哥分校的研究者查看加州27年的死亡证明后有如下发现。名字的首字母“积极的”如，JOY，WOW，ACE，GOD，WIN，VIP，比控制组的人要多活4.48年，后者的名字首字母则较为含混，既可以作积极的解释也可以作消极的解释，如DAM，WET，RAY，SUN。而名字首字母“明显负面的”如ASS，DUD，比控制组平均早死2.8年。
作为练习，在不违背本章讨论的标准的前提下提出对上述发现的解释，说明你如何检验这个解释。
最后要说的是，从抽象的宇宙的起源到具体的汽车不能发动，我们如何运用最佳诊断的方法形成假说。对于相信上帝的人而言，对于如下诸多现象上帝是最佳的“诊断”：爱、道德、生命的出现、宇宙的浩淼和复杂、似乎存在的整体设计以及奇迹等等。假如你的汽车不能发动而你要在20分钟内赶到麦当劳轮班，你运用求异法试图寻找其他不同现象。遗憾的是，“不同”往往不止一个：上次你发动汽车时听见奇怪的啪嗒–啪嗒声，天气异常冷，你刚加了新品牌的汽油，试着发动汽车时你闻到了特殊的气味，你刚安装了新电池，你准备在车里给手机充电（但并没充成），一周前刚给汽车安装了新音响，等等。运用你对汽车的机械原理和事物之间因果联系的知识，你会寻求对各种事实的正确诊断，哪些“诊断”与这些“症状”联系？最明显的诊断是电池不足。需要注意的是存在着一些症状与该诊断不一致甚至相冲突，就像布朗·戈德曼被杀案件的有些证据与辛普森的诊断不符，或许你腿麻的有些症状与医生认为的最佳诊断不一致。