日军撤离朝鲜
万历二十六年十一月十九日巳时（上午9时至上午11时），刘在小西行长等日军撤离顺天倭城后[27]，率领西路军进入该城。他搜出小西行长之前按照约定留在城内的首级，又将小西行长交给他的6名日本人质全部杀死以充首级，而那些散落在山谷中、被日军俘虏的朝鲜人也被刘
斩杀以充首级。之后，刘
以金字大书“西路大捷”四字，飞报经略邢玠。（《象村稿》）据说，刘
又在南原聚集铁匠，让他们打造和日军一样的刀枪，还向朝鲜都元帅权栗讨要日军的首级和倭衣。回到王京后，刘
将这些首级、军器、倭衣陈列在军前，夸耀自己的功劳。（《宋经略书》）即便如此，刘
上报的西路军斩首数目，也不过才160级。（《宣祖昭敬大王实录》）
尽管刘是在小西行长撤走后才入据顺天倭城的，但邢玠却将小西行长撤走的功劳归于刘
，在战报中称刘
在夜里攻破顺天倭城，日军不敌退走：“刘
原在西路堵截行长，督兵大战，擒获见解倭将阿干苔力思结，及从倭马过什罗信、什罗啰嘧、马搭也门。及夜，攻破行长住城，行长逃遁。”（《经略御倭奏议》）
麻贵统领的东路明军自加藤清正从蔚山倭城撤退以后，就占领了这里。接着，他们进入西生浦，一直追击侵朝日军至他们在朝鲜的大本营——釜山浦，在此与日军交战。但是战果却微乎其微，东路军只擒获了两个日军士兵“善叟戒”“见次郎”。十一月二十二日，麻贵又在釜山浦与日军交战，同样战果很小，只擒获三个日军士兵“敝古老幺兵”“卫马大时老”“信哥落”。
清正于十一月十七日夜，放火烧营遁去。麻贵统兵入西生浦，及追至釜山与倭对敌，擒获见解倭兵善叟戒、见次郎。二十二日，清正迎敌射砍，又擒见解倭兵敞古老幺兵、卫马大时老、信哥落。清正遂发船，尽逃回对马岛。（《经略御倭奏议》）
而东路军因为受日军铁炮攻击，阵亡了三名千总，损失远远大于日军。（《宣祖昭敬大王实录》）
十一月二十四日，加藤清正、锅岛直茂、黑田长政、毛利吉成、秋月种长、高桥元种、相良赖房、筑紫广门等残留在庆尚道东南面的侵朝大名集结在釜山浦。他们遵照丰臣五大老下达的退兵命令，于上午10时放火焚烧釜山倭城，从朝鲜撤兵回到日本。（《宇都宫高丽归阵物语》）
事后，邢玠在战报中将加藤清正撤走之归功于麻贵，认为加藤清正是被麻贵打跑的。然而麻贵本人却并不认为如此简单。釜山日军撤去后，麻贵与给事中、御史、按察使登上高处，眺望釜山东、西两边的日本营寨。官员们都说：“（釜山）外寨可破，内城天难讨矣，薄城则人命可惜。贼之退去，是乃天也。”他们认为釜山城外寨虽可攻破，但内城实无可能攻破，如强行攻城只会白白牺牲人命，日军的退去乃是上天的安排。麻贵也流露出悲观情绪，认为以釜山城的坚固，自己无法将其攻破，因而说：“如此，故麻贵不能讨也。”（《宣祖昭敬大王实录》）麻贵不认为日军是被他驱逐的，侵朝日军之所以撤离朝鲜，关键还是丰臣秀吉死了。这在麻贵之后与朝鲜李朝国王李昖的一次对话中可以看出：
上谢之（麻贵），仍问曰：“大人亲履釜山、岛山及沿海诸寨，形势如何？”
（麻贵）曰：“今次贼之退也，或出于关白之死。早晚更来，其肆毒必甚矣……”（《宣祖昭敬大王实录》）
麻贵认为，日军撤走可能是因为丰臣秀吉的去世，还认为日军早晚再次入侵朝鲜，届时肆虐程度将更甚从前。
十一月二十七日，岛津义弘、岛津丰久、小西行长、立花宗茂、小早川秀包、寺泽正成、宇都宫国纲、松浦镇信、有马晴信、大村喜前、五岛玄雅、宗义智等残留在庆尚道西南面的侵朝大名逃回釜山浦，之后也从这里起航，渡海撤回日本。（《宇都宫高丽归阵物语》）明军与日军议和时，曾送给日军一些人质：西路军刘送交日军的人质有刘万寿、王建功，中路军送交日军的人质有毛国科，水路陈璘送交日军的人质有陈文栋。连同这些主要人质在内，日军还带上了刘
送去的家丁中的30人、茅国器送去的家丁中的19人（《宣祖昭敬大王实录》），将他们作为战利品带回日本。
至此，侵朝日军大部队撤出朝鲜境内，只留下一些残寇，明军为此展开搜捕。十一月二十九日，麻贵的东路军进剿釜山浦西南面的多大浦，在这里抓获了一个没来得及逃走的日军士兵“善叟戒”。十二月五日，麻贵又在多大浦擒获“敝古老”等两名日军士兵。从结果来看，东路军的战果依然非常小，最后只擒获了三个落单的日军士兵。可见，此时陆地上的日军基本已经走光了。
唯一取得些许战绩的是陈璘的水军。在十一月十九日的露梁海战中，一些日军受到明朝、朝鲜水军的冲击，被迫逃到南海岛上。他们中虽然有部分人后来获得同伴的救援，跟随大部队逃回了日本，但仍有人没来得及被带走，还留在岛上。十一月二十一日四更，陈璘的水军进攻南海岛，只见日军船只已空，但山上仍有火光，过了很久才熄灭。天亮后，明军登上南海岛的日军巢穴，岛上残留的日军见到明军的身影后吓得向后山逃去，明军见地上有马粪被用来烧火，知道日军逃去不久，于是展开了进一步的搜捕。（《明神宗实录》）
十一月二十九日，陈璘的水军进剿南海岛的锦山，擒获“沙四吉”等两名日军士兵。（《经略御倭奏议》）其余躲藏在南海岛的日军越藏越深，无论明军如何引诱，他们都不出来。这些日军因为担心明军搜捕到他们，又逃到了南海岛的乙川山。
十二月十日夜，陈璘亲督所部，进剿乙川山。第二天天亮以后，陈璘督军对乙川山的日军“发铳炮”，结果“倭奴震惊，拥众冲登凌山，以高临下，为负隅之势，官兵奋勇仰攻，斩级十颗”。此外，还有一名日军士兵“那莫哥”被明军擒获。
经历乙川山之战后，日军残寇逃到了南海岛的了口。陈璘又下令明军“分道扼塞，十一日再进，奋战良久”，于是“贼大败奔北，璘乘胜蹙之，擒斩九十余名颗。复督兵爬搜，无一余孽”。明军再次取得了口之战的胜利，歼灭了南海岛上的残留日军。
据《明神宗实录》记载，自七月以来，陈璘的水军一共获得日军首级1100余颗。
十二月十五日，邢玠派遣快骑向明朝兵部汇报，称仰仗皇上英明，东征军在日军“思归”之际，乘胜进兵，以武力将日军驱逐出朝鲜境内：
自狡倭悖逆，残我属藩，营釜山之兔窟，肆三路之鸱张。致勤宵旰，东顾隐忧，两次兴师，七年劳费。兹仰仗皇上圣武英断，一意尽剿，为期天心助顺，将吏协谋，值穷寇之思归，乘胜兵而攻逼，致令贼势窘促，扫穴而逃。祸本既拔于穴中，游魂复歼之海上。至是，而皇上字小之义有终，属国效顺之心益固矣。
邢玠又上报露梁海战大捷，伪称岛津义弘被明军飞弹打死：
近者，倭兵二万余，舟以六七百计，纠釜山、泗川、巨济、闲山各倭将，悉力西援行长。总兵陈璘即身先将士，鼓众大战，铳死大倭将石曼子（岛津义弘），又生擒一部将，其焚溺死者无算。虽水中不能割级，而犹斩获三百余颗。功收全胜，妖氛已平。（《明神宗实录》）
虽然邢玠上报的打死岛津义弘的消息有误，属于伪报战功，后来也被明朝朝廷与朝鲜方面知道了实情，但并不会影响到丰臣秀吉以其野心发动的侵朝战争，就这样落幕了。正如《近世日本国民史·朝鲜役》所指出的那样：“惊天动地的大活剧，终以龙头蛇尾告终。”
日军撤退回国以后，又发生了两件有意思的插曲。
第一件事，据《看羊录》记载，日本境内到处流传着明、朝联军将要渡海攻打对马岛的消息，对马岛岛主宗义智吓得逃到了“倭京”。日本人心惶惶，但谁也不敢发言说去救对马岛。
第二件事，据《汉阴文稿》《宣祖昭敬大王实录》记载，对马岛岛主宗义智写信给朝鲜，责备明朝不讲信用，没有按照此前与日军的约定，将朝鲜王子送到日本去。这原本只是明军为了诱骗日军从朝鲜撤兵开出的空头支票，日军却当了真。此时大局已定，朝鲜王子是不可能作为人质的。因此宗义智这番话，只是虚张声势。
从结果来说，丰臣秀吉发动的侵朝战争，不但未能达到他一开始设想的吞并朝鲜、明朝的目的，反而为他的政权灭亡埋下了祸根。加藤清正渡海撤回日本以后，趁小西行长还没回来，就嘲笑一向与他关系不睦的小西行长怯懦。小西行长晚加藤清正一步回到日本，从别人那里听到这些话后很不服气，宣称：“清正还没等带回朝鲜王子作为人质，就一下子焚烧掉营寨撤退了，使与朝鲜议和一事功败垂成。我和岛津至少还带了几个大明人质，从容殿后回到日本。到底是我怯懦，还是清正怯懦？”（《看羊录》）
丰臣五大老之一的毛利辉元，因与朝鲜议和之事不成，埋怨加藤清正。加藤清正一派的人，也因为小西行长在侵朝战争中多次与朝鲜暗通款曲，而看小西行长不顺眼。两派矛盾越来越深，这为后来的关原之战埋下了伏笔。
丰臣秀吉发动的侵朝战争，不但未能实现他的野心，反而给丰臣政权埋下了灭亡的种子，这正是其可悲之处，也应了那句老话：“搬起石头砸自己的脚。”