洞松院尼控制包括播磨在内的三个领国一直到十六世纪初期，在其北面的山阴之地，诞生了一个大人物。这个出生于出云富田城（今岛根县广濑町），兴起于洞松院尼晚年的人物名叫尼子经久 [1] 。尼子氏为富田城守护京极氏的庶族一脉。南北朝末期，出云为山名满幸的领国。但是满幸在明德之乱后没落，京极高诠成为新守护。高诠去世后，近江犬上郡的武士尼子持久（相当于高诠的叔叔），成为新守护代。
以出云为中心，伯耆、安芸、备后等地为当时优质铁砂矿的产地，以鞴（双脚交互踩踏鼓风）为主要生产方式的金属冶炼业随之兴盛起来。出云所在的日本中部的山脉地区部分地方溪谷平缓、多河川，当地人因地制宜，利用这种地形发明一种称为“铁穴流”的独特采矿法。他们充分利用溪流的冲刷，和高度差形成的重力将铁砂从沙砾中甄选出来。从此种铁砂中提炼出来的钢富有强度和韧性，因其品质上乘，被称为“玉钢”，成为锻造日本刀等刃具的最佳原料。据一四四五年（文安二年）兵库关隘的通关台账《兵库北关入船升米账簿》（灯心文库藏）记载，儿岛、牛窗、连岛、因岛等为当时从事铁交易的港口。这些从云备地方运往畿内的鉧（用铁砂矿炼制的钢块）多由中部山脉地区出产的铁炼制而成。鉧被运到作为中转站的美保或安来地方后，美保关对此要征收一定的税钱。大名尼子家以“守护分”的名义每年会从中抽取五百贯。
出云的铁大概也出口到中国和朝鲜。从城下的富田川河底发掘出来的遗物中有很多是涂有元、明时期釉色的瓷器。这些瓷器应该是尼子氏与朝鲜交易的物品。通过经营铁贸易，尼子氏势力日益壮大，进入十六世纪后，尼子氏国富兵强，逐渐吞并了周边藩国。
爆发于一三九一年的“明德之乱”就缘于守护山名满幸对横田庄的横征暴敛。出云的横田庄为日本生产玉钢的中心。自南北朝以来，铁成为战略性物资，围绕争夺铁资源和掌握其流通权，横田庄成为众多势力的征伐之地。之后的守护政高因忌惮经久的威势，于应仁之乱后的一四八四年，让盐冶取代了经久继任守护代一职。翌年正月，经久得到城下的钵屋民众帮助潜入城内制造混乱，并趁机占领城池，凭实力重新夺回守护代之职，但也因此坐实了“国贼”的污名。但无论如何，势力崛起的经久与东边的伊势宗瑞（北条早云）形成两足并立之势。
从一五一八年（永正十五年）开始，经久的军事势力开始增强。在那之前，其一直作为臣下追随大内义兴。当时的义兴与细川高国在畿内建立了联合政权。从一五〇八年到一五一六年（永正五年到十三年），经久一直在京城听命于义兴驱策。一五一六年，经久离开京城，脱离了大内义兴回到属国，此后走向政治军事的独立化，就此拉开了称霸山阴地区的帷幕。
大内与尼子的角逐出云的三刀屋、赤穴等地方盘踞着拥有很强独立性的强力武士势力，经久用了差不多二十年的时间将其收服。尼子氏大概在这一时期开始扩张势力范围。一五一八年（永正十五年），伯耆的南条氏吹响了经久发起军事行动的号角。随后经久于一五二一年（大永元年）攻破石见。得到西条盆地周边芸北地区的武士势力的归顺，经久军事力量显著增强。为了防范经久，大内氏方面于一五二二年将陶兴房（晴贤之父）派到安芸。翌年八月，大内义兴与大内义隆父子二人亲自出征安芸。义兴大军将大营驻扎在严岛后，对樱尾、银山（今广岛市）等城发起攻击。受此影响，尼子方面保卫芸南地区的呼声陡然高涨。如此一来，围绕着由大内氏世代管辖的安芸城周边地区的统治权，尼子与大内两军展开了殊死搏斗。
一五三七年（天文六年）年末，一直在尼子和大内两大名之间首鼠两端的土豪毛利元就决定投靠大内，被激怒的尼子经久派孙子晴久发兵安芸。一五四〇年（天文九年）九月，晴久军长驱直入因、伯、云、备，随后以三万兵力包围了在安芸郡山城的毛利元就。在此之前的一五三八年，晴久曾挥师东征，通过美作攻打播磨，占领木山城（今兵库县新宫町），对赤松氏形成军事压制。可是赤松氏并没有屈服，转移到西面的安芸。尽管如此，仅仅一年，晴久军队还是以迅雷不及掩耳之势从播磨长驱直入安芸。郡山城被包围之后，毛利方面军收缩防线，准备据城死守。
大内义隆为了救援毛利，亲征岩国。翌年正月，毛利与大内联军在郡山城打败尼子军取得大胜。大内军乘胜追击，消灭了友田、武田等归顺尼子的名门望族。自镰仓以来，安芸的守护、御家人 [2] 等除毛利一家外皆被一一剪除。
一五四一年（天文十年），经久去世，享年八十四岁。一五四二年正月，大内义隆倾分国一万五千多的兵力誓要荡平尼子氏。在此之前的一五三三年（天文二年），在石见的大森银山，一种关于银的冶炼法被发明了出来。继铁之后，银又成为尼子和大内两方争夺的对象。本想三个月拿下石见赤穴城的大内军到达松江平野后，凛冬已至，严寒逼袭对大军造成很大影响，大内军只好途经罗木山驻扎，直到一年以后才再次出兵。这段时期由于战线紧缩，原来归顺的土豪们很多都转而投靠尼子军。鉴于形势有变，大内军决定于五月七日撤退。这场空前的远征以失败告终。
富田城战役的失败成为大内氏势力衰颓的转折点。大内义隆不同于一般的战国武将，他对京都文化充满憧憬，又多仰仗公卿的支持，所以需要庞大的经费支出。领国的民众因此负担很重。沉重的赋税终于招致重臣陶隆房的反叛。一五五一年（天文二十年）九月，。义隆被逼无奈自刎于长门宁寺。而对手尼子氏在大内氏衰微之后控制了备后。一五五二年（天文二十一年），晴久被将军义辉授予云、隐、因、伯、作、备等八国的守护，成为当时全日本统领分国数量最多的大名。可是，就在发动反叛逼死主君的陶隆房（后改名晴贤）正欲发展壮大之时，却在一五五五年（弘治元年）十月，在有名的严岛之战 [3] 中，遭到毛利元就军的偷袭而战死。自此以后，中部地区形成了尼子与毛利两强并立的局势。
蓝染和木材之国据称，三好氏出身于信浓小笠原氏，于南北朝时期入阿波小笠原氏，祖居阿波三好郡，应仁之乱时，成为阿波西三郡的守护代，后因文明末年爆发的一揆运动而发迹，人称三好之长。如前文所述，细川政元无子嗣，把阿波守护细川成之的孙子细川澄元收为养子。一五〇六年（永正三年），澄元被任命为摄津守护，作为成之下官的三好之长跟随澄元进京受封，不久被任命为摄津守护代。正如洞松院尼的章节中所言及的，一五〇七年至一五〇八年（永正四年至五年）的战乱之后，三好之长举兵拥立澄元，后兵败逃走，最终于一五二〇年（永正十七年）五月，在京都等持寺的战役中大败于细川高国而被处死。其后继者三好元长（之长之孙）于一五二六年举兵拥立澄元之子晴元。元长军从阿波经和泉堺入京城，活跃于畿内邻国一地，之后作为细川氏的下官同畿内的武士势力对立，被主君晴元抛弃，后晴元借“一向一揆”之力于一五三二年（天文元年）六月，攻打和泉堺，杀死元长。元长的后继者为有名的嫡子长庆。
三好氏以阿波为根据地，到了战国时期，越过大海兵进畿内，作为细川下官中最有势力的一方而活跃着。当时三好氏的屯兵基地为贸易都市堺。现在的堺市北部还立有一块“三好氏海船馆址”的石碑，附近多为木材经销商，这里被认为是三好氏的住宅遗址。有关海船馆遗址的传说称，当时堺的大商人只收购阿波产的木材，并将其视为重要战略物资。据前文提到的《兵库北关入船升米账簿》记载，一四四五年，从阿波各个港口运往兵库的木材为二万八千五百石，其中出货量最大的港口为海部，约有九千石。除阿波外，其他的领国几乎没有留下木材贸易的记录。还有作为近代阿波专卖品的蓝染约有四百石从阿波流入畿内。毫无疑问，阿波在室町时代就已经成为木材和蓝染的一大生产基地。这些物资的中转站在应仁之乱前为兵库，之后则转移到堺。在堺的商贾中多为与三好氏关系密切的政商。
一五二六年（大永六年）年末，元长在堺登陆，此时的他已拥立作为候补将军义晴的弟弟义维。而义晴只好逃亡近江的朽木，之后在近五年的时间里都没有返回京都。这期间，义维在和泉堺的金莲寺对外发号施令，成为实际上的将军而君临畿内。根据当时的政治形势，世人也把元长称为“堺公方”或者“堺大树”，反映出三好氏在堺的雄厚实力。
元长去世之时，其子长庆虽然还只是一个十岁的孩童，但辅佐的老臣们都还健在。翌年，众老臣们以“三好千熊丸（长庆）”之名同石山本愿寺、细川晴元展开谈判。一五三九年（天文八年），长庆与旧主晴元议和，成为摄津西一半领国的守护代、越水城（今西宫市）城主。翌年，长庆同丹波的土豪波多野秀忠之女结婚，一五四八年（天文十七年）又娶河内守护代游佐长教之女。通过这些政治联姻，长庆逐渐巩固了在畿内的政治地位。同年八月，羽翼丰满的长庆再次发动针对主君晴元的叛乱。一五四九年（天文十八年）六月，长庆在摄津江口的战役中一举击溃晴元大军，终于如愿入主京城，成为统御畿内的霸主。
与旧势力的缠斗与其他大名统辖之地不同，京畿是被天皇、将军和公家寺社等众保守势力占据的固若金汤的城池，仅靠军事压制是无法统御畿内的。正因如此，亡命近江的义晴、义辉将军父子以及细川晴元等势力顽强抵抗着长庆的统治，誓要夺回京都。这一时期，传入种子岛的葡萄牙铁炮被天文年间因法华之乱而亡命于堺的日莲宗僧侣传到了畿内，晴元军迅速配备了这种新式武器。一五五〇年（天文十九年）七月，在洛中战役中，长庆军中一位叫三好弓介的军人被晴元军的铁炮击毙。这也是日本历史上第一次使用铁炮进行的战争。同年二月，义晴筑起中尾城，为了防御铁炮，用掺入小石子的白灰涂满城墙。将军义辉得知无法将三好军赶出京都之后，便组织暗杀团伺机刺杀长庆。一五五一年三月，长庆在京都的一场宴会上遭到刺客暗杀负伤，同年五月，长庆的岳父游佐长教在高屋城内被暗杀。
像这样，将军义辉（义晴于一五五〇年去世）同长庆上演了历时四年多的京都争夺战。一五五三年（天文二十二年）八月，将军义辉最后的据点灵山城被长庆军以大炮攻陷，义辉逃亡近江朽木，剪除异己的长庆则作为最高权力者统治畿内长达五年之久。在此期间，长庆将主城从摄津越水迁移到芥川（今大阪府高槻市），并在前执事伊势贞孝和其他室町幕府官吏的支持下，获得了对山城、丹波、摄津和淡阿赞等畿内四国以及旧细川氏的六个领国的统治权。这个政权的意义在于，在畿内第一次建立起了不以幕府之名为前提的独立的大名统治政权。但维持这样一个政权实属不易，其短短存在了五年就瓦解了，实在是一个短命政权。甚至于连之后的织田信长也体味到了那个时候长庆政权的种种不易。可以说，从一五五三年到一五五八年存在五年的三好政权具有了作为织田政权的先驱的历史意义。
历史上的长庆是一个颇有教养又广受武将爱戴的杰出人物。正因如此，长庆始终无法下决心将足利将军家放逐，彻底削弱其实力。相反，一五五八年（永禄元年）十一月，长庆与义辉议和，并把京都让于后者，使已行将就木的幕府得以复活。这显然是大名政权对幕府的妥协，是一种历史倒退。其后，三好氏把河内、大和、和泉三国并入版图，作为形式上的将军属臣而实施统治。但对此颇为不满的三好长逸、三好宗渭和岩成友通三人与手下松永久秀在长庆死后对将军实施了暗杀。这件事也反映出畿内的旧势力与大名之间围绕权力的激烈博弈。
注释：
[1] 尼子经久为出云国的武将、大名，绰号云州之狼，擅长谋略，与毛利元就、宇喜多直家被并称为“中国（指日本中部地区）三大谋将”。尼子经久以其“下克上”的传奇经历而与北条早云、斋藤道三等人齐名，曾做过出云国守护代，之后由于过于追求扩张领地而被罢免，后又白手起家夺回了出云国的领地，并发展成为拥有山阴山阳十一国的超级大名，被后人誉为战国“阴阳一太守”。
[2] 御家人意指镰仓时代与将军直接保持主从关系的武士。“家人”最初为贵族及武士首领对亲信部下武士的称谓，镰仓幕府成立后，将军被敬称为“御”，故有“御家人”一词。
[3] 弘治元年（1555年）十月，安艺国严岛（今广岛县）爆发一场战争，对战双方为毛利元就和陶晴贤，最后毛利军取得了胜利，史称严岛之战。